O Termas São João conta com uma ampla estrutura física que contempla:
- Centro Administrativo;
- Piscinas externas com toboágua, área para banho de sol;
- Piscina interna térmica, infantil e semiolímpica;
- Sauna Úmida;
- Restaurante servindo almoço, pratos a lá carte, buffet sob reserva. Além de uma grande variedade de lanches e porções;
- Espaço de culinária japonesa
- Cantina;
- Sorveteria;
- Mini mercado;
- Cafeteria;
- Agência de viagens;
- Alameda do Comércio que é composta por lojas de diferentes segmentos;
- Salão de eventos com estrutura de mesas e cadeiras para: casamentos, festas de aniversário, formaturas, encontros empresariais, entre outros;
- Ginásio com duas quadras de tênis, futsal e vôlei;
- Espaço de boliche com quatro canchas, mesas de sinuca e Bistrô;
- O Camping é composto por quiosques, mesas com churrasqueiras ao ar livre para acampamentos com energia elétrica de 220V e banheiros. Os visitantes podem usufruir de um belo e sossegado local para instalação de suas barracas.
- Dispomos de dois lagos, sendo um para pague e pesque, e ainda, quadra de vôlei de areia, trilha ecológica ao longo do rio Fortaleza;
Além do camping, o Termas São João disponibiliza aos visitantes acomodações entre quitinetes, apartamentos, cabanas e chalés.